董氏基金會以「促進國民身心健康、預防保健重於治療」為宗旨，致力於「菸害防制、食品營養、心理衛生」三大領域的工作。就菸害防制方面，推動《菸害防制法》立法、參與WHO《菸草控制框架公約》相關會議、成立亞太地區拒菸協會；食品營養方面，則關注國人體重控制、兒童營養午餐衛生環境、食品營養標示及健康飲食等；就心理衛生方面，參與國際心理健康會議、從事調查研究、辦理講座訓練、發展憂鬱症量表，提醒國人自我情緒覺察。
政府決策需權衡諸多政治及經濟利益，倘若公益議題的改革只仰賴政府機關、排除非政府組織的參與，往往事倍功半。透過跨國界研究單位交流資訊，並由非政府組織向社會進行倡議、促進群體觀念發生改變，有助於監督施政、落實改變。